NGS BASED SERVICE
Pathogen Fast Identification
Identifikasi pathogen melalui NGS memberikan informasi yang akurat terkait adanya bakteri pathogen pada sampel bahan yang diteliti, sehingga penanganan yang terarah dapat diterapkan.
Transcriptome Analysis
Analisis terhadap data RNA (transkriptom) memberikan pengetahuan terkait regulasi ekspresi gen pada tingkat seluler, respon sel terhadap perlakuan yang diberikan maupun kondisi yang terjadi di lingkungan. Gen yang meningkat (upregulated) maupun menurun (downregulated) dapat diidentifikasi melalui analisis transkriptom. Melalui analisis ini, komunit mikrobiom yang aktif pun dapat di ketahui.
Whole Genome Analysis
Whole genome analysis (WGS) menawarkan informasi yang komprehensif mengenai gen-gen fungsional dari suatu organisme atau dari suatu lingkungan (metagenome), identifikasi gen-gen yang beneficial untuk industry maupun identifikasi gen resisten terhadap antibiotic untuk penanggulangan bakteri pathogen dengan lebih terukur. WGS juga mendukung konservasi ataupun pemuliaan tumbuhan/hewan di Indonesia.
Biodiversity Analysis
Biodiversity analysis merupakan tools NGS yang sangat powerful untuk menentukan komunitas struktur mikrobiom dari suatu sampel lingkungan seperti tanah, air, sistem inang, bahkan hingga ke lingkungan ekstrim (temperatur tinggi maupun kadar garam tinggi). Informasi yang sangat penting dalam menentukan keberadaan pathogen yang mungkin berbahaya bagi manusia maupun hewan ternak.
Genotyping by Sequencing
Genotyping by sequencing (GBS) menunjukkan varian genetik pada urutan sekuen DNA dalam bentuk Single Nucleotide Polimorphism (SNPs). Pola SNPs dapat menjelaskan perbedaan antara dua individu yang berkerabat dekat, menjelaskan mutasi yang terjadi, dan substitusi asam amino yang presisi melalui NGS.
Telepon :+622517532348
Email: sgi_riset@saraswanti.co.id
Alamat : Graha SIG, Lantai 9, Jl. Rasamala No. 20 Taman Yasmin, Curugmekar, Kec. Bogor Barat, Kota Bogor Jawa Barat 16113.
Telah Terakreditasi Oleh:
