Bioinformatic Analysis
Community Structure (16S)
Analisis bioinformatika untuk data 16S merupakan analisis yang sudah well established dengan pipeline yang komprehensif dan mendetail. Baik data yang dihasilkan teknologi short- read sequencing maupun long-read sequencing dapat dilakukan analisis dengan pipeline yang tersedia.
Whole Genome Assembly
Untuk melakukan assembly data whole genome, dapat digunakan teknologi sekuensing short-read maupun long-read, atau dengan memadukan keduanya (hybrid). Banyak perangkat lunak tersedia untuk memproses data-data tersebut dengan akurasi assembly yang baik.
Extra Nuclear Genome Analysis
Genom pada makhluk hidup terbagi ke dalam DNA inti (nuclear DNA) maupun DNA luar inti (extranuclear DNA) seperti halnya kloroplas, mitokondria dan plasmid. Masing-masing DNA luar inti tersebut dapat digunakan untuk analisis hubungan kekerabatan, maupun identifikasi taksonomi.
Gene Annotation
Anotasi gen merupakan proses identifikasi lokasi daripada gen tersebut, termasuk DNA coding regions dan menentukan apa fungsi dari gen tersebut.
Differential Gene Expression
Differential Gene Expression (DGE) digunakan untuk analisis dan interpretasi gen- gen yang di transkripsikan pada data transkriptom. Melalui analisis DGE, kelimpahan gen yang ditranskrip dapat ditentukan dan dikuantifikasi.
Meta Analysis
Meta-analysis merupakan sebuah studi yang menggabungkan hasil dari beberapa studi dan dianalisis dengan metode statistik yang sesuai.
Telepon :+622517532348
Email: sgi_riset@saraswanti.co.id
Alamat : Graha SIG, Lantai 9, Jl. Rasamala No. 20 Taman Yasmin, Curugmekar, Kec. Bogor Barat, Kota Bogor Jawa Barat 16113.
Telah Terakreditasi Oleh:
